L'alchimie en vint à être considérée comme une méthode pour atteindre le salut de l'âme.
Une autre nouvelle voie de l'alchimie se développa au cours de cette période, qui vit des penseurs prendre les principes de l'alchimie comme une allégorie pour une recherche purement philosophique. Les alchimistes eux-mêmes utilisaient de plus en plus un langage allégorique et métaphorique pour leurs recherches et leurs ingrédients. Un vocabulaire courant apparaît, tel que "mariage", "naissance" et "mort", pour décrire les processus alchimiques. La triade de substances si chère aux alchimistes - le mercure (qui représente la volatilité), le soufre (la combustibilité) et le sel (la stabilité) - fut même assimilée à la Sainte Trinité du christianisme. L'alchimie en vint à être considérée comme une méthode pour atteindre le salut de l'âme. Au lieu de trouver des solutions longtemps recherchées, l'alchimie semblait devenir plus loufoque et plus ambitieuse, mais les creusets ne scintillaient toujours pas pour autant d'or.