उनके मन में उन दिनों चल रहे कृत्रिम चयन (Artificial selection) यानि इंसान द्वारा अपनी मर्जी के मुताबिक लक्षणों का चुनाव कर जानवर और पौधों की अलग-अलग प्रजाति तैयार किए जाने की बात थी.
बीगल का सफर खत्म हुआ तो डार्विन ने लंदन लौटकर अपने नोटों और सैंपल्स का गहन अध्ययन किया. उनके मन में उन दिनों चल रहे कृत्रिम चयन (Artificial selection) यानि इंसान द्वारा अपनी मर्जी के मुताबिक लक्षणों का चुनाव कर जानवर और पौधों की अलग-अलग प्रजाति तैयार किए जाने की बात थी. उनके मन में यह विचार कौंधा कि अगर इंसान नई प्रजाति तैयार कर सकता है तो क्या प्रकृति में दिखने वाले इतने विविध जीव प्रकृति में लगातार होने वाली किसी चुनाव प्रक्रिया का परिणाम है? लेकिन डार्विन के पास यह संकेत देने वाला कोई सूत्र नहीं था कि चुनाव की यह प्रक्रिया प्रकृति में कैसे लागू होती है.